Η μεροληψία επιλογής εμφανίζεται όταν υπάρχουν συστηματικές διαφορές μεταξύ των ομάδων σύγκρισης σε μια μελέτη. Για παράδειγμα, οι διαφορές στα κλινικά σημεία μεταξύ των ομάδων μπορεί να οδηγήσουν σε διαφορετική εξέλιξη της νόσου ή ανταπόκριση στη θεραπεία μεταξύ των ομάδων, και όχι στην ίδια την παρέμβαση. Δεν έχει επιτευχθεί η σωστή τυχαιοποίηση και/ή τυφλοποίηση, γεγονός που μπορεί να επηρεάσει τη στατιστική ανάλυση και την εσωτερική εγκυρότητα της μελέτης.

Η μεροληψία επιλογής χρησιμοποιείται μερικές φορές για να αναφερθεί σε ένα σφάλμα στην επιλογή των μελετών για ανασκοπήσεις. Η μεροληψία δημοσίευσης είναι ένας τύπος μεροληψίας επιλογής. Παραπλανητικά, η μεροληψία επιλογής χρησιμοποιείται επίσης μερικές φορές για να αναφερθεί σε συστηματικές διαφορές μεταξύ της ομάδας μελέτης και του γενικού πληθυσμού. Αυτό οδηγεί σε προβλήματα με την εξωτερική εγκυρότητα.